Υπάρχουν δύο σημεία τα οποία μαρτυρούν το κτίριο που ήταν το αρχαίο Δεσμωτήριο στο οποίο φυλακίστηκε ο Σωκράτης.
Εκατό περίπου μέτρα από τη νοτιοδυτική άκρη της αγοράς, ανάμεσα σε ερείπια κατοικιών και εργαστηρίων, εντοπίσθηκε ένα πώρινο δημόσιο κτίριο που ταυτίζεται με το Δεσμωτήριο των κλασικών χρόνων.
Το οικοδομικό υλικό είναι πενιχρό εξαιτίας των διαρπαγών. Ανάμεσα στα ευρήματα ξεχωρίζουν 13 πολύ μικρά αγγεία, ίσως αυτά στα οποία έβαζαν κώνειο για τους καταδικασθέντες σε θάνατο. Επίσης, βρέθηκε ένα φθαρμένο αγαλματίδιο του Σωκράτη. Όλα αυτά, συνδυαζόμενα με τις μαρτυρίες από τους Πλατωνικούς Διαλόγους και τον Πλούταρχο, συνηγορούν στο ότι το πώρινο κτίριο ήταν το αρχαίο Δεσμωτήριο και συνεπώς η «Φυλακή του Σωκράτη», εκεί όπου ο μεγάλος φιλόσοφος άφησε την τελευταία του πνοή.
Δείτε την εκπληκτική ψηφιακή απεικόνιση.
H δεύτερη εκδοχή είναι στην ανατολική πλευρά του λόφου Φιλοπάππου υπάρχουν δύο σπηλιές λαξευμένες στο βράχο γνωστές ως Φυλακή του Σωκράτη.