O Μητροπολίτης Μυτιλήνης τελικά αποφάσισε να κινηθεί εναντίον ομάδας ιερέων της Μητρόπολης του οι οποίοι κατηγορούνται ότι όχι μόνο αρνούνται να εμβολιαστούν αλλά και προτρέπουν πιστούς και να μην εμβολιάζονται και να μην τηρούν μέτρα προστασίας από την πανδημία της νότου του κορωνοϊού. Έτσι στάλθηκαν δυο ειδών επιστολές.
Η πρώτη που το αποκάλυψε σε όσους από τους 35 περίπου ιερείς προφασίζονται λόγους υγείας για να μην εμβολισθούν ζητώντας τους ιατρική βεβαίωση δημόσιου νοσοκομείου περί του προβλήματος τους. Και η δεύτερη, η πολυσυζητημένη αυστηρή επιστολή προς τέσσερις - πέντε η οποίοι πρωταγωνιστούν στο... αντεμβολιαστικό κίνημα στη Λέσβο.
Σε δυο από αυτούς έχει και στο παρελθόν επιβάλει για τη στάση τους ποινές.
Στον έναν χωριού της περιοχής του Ευεργέτουλα αφήρεσε το οφίκιο του πνευματικού, του απαγόρευσε δηλαδή να εξομολογεί. Ο λόγος ότι αρνήθηκε να κάνει Ανάσταση σύμφωνα με τις αποφάσεις της Ιεράς Συνόδου στις 9 το βράδυ του Μεγάλου Σαββάτου αλλά έκανε Ανάσταση στις 12 τα μεσάνυχτα.
Παρά όμως το επιτίμιο αυτός συνέχισε τη δράση του και μάλιστα ερευνάται το ότι μεγάλο μέρος της διασποράς των τελευταίων ημερών οφείλεται στον χωρίς απολύτως καμία πρόληψη εορτασμό του Αγίου Δημητρίου στις 25 και 26 Οκτωβρίου.
Στον άλλο ιερέα χωριού βόρεια της Μυτιλήνης, είχε επιβληθεί ποινή αργίας και στέρησης μισθού αφού καλούσε και με ανακοίνωση του έξω από το ναό τον κόσμο να μη φορά μάσκες.
Η ίδια αυστηρή επιστολή εστάλη και σε άλλους τρεις ιερείς.
Σύμφωνα με κύκλους της Μητρόπολης Μυτιλήνης ο κ. Ιάκωβος «εξάντλησε κάθε προηγούμενη συζήτηση με τους συγκεκριμένους ιερείς και προχώρησε στη λήψη των συγκεκριμένων μέτρων αφού είδε πως η δράση τους καθίσταται πλέον εμφανώς επικίνδυνη για τη δημόσια υγεία».
